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西田　洋巳 (ニシダ　ヒロミ)

  • 食環境科学部食環境科学科　教授
  • 食環境科学研究科食環境科学専攻　教授
Last Updated :2026/02/22

研究者情報

学位

  • 博士（農学）（1995年03月 東京大学）

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J-Global ID

研究キーワード

  • 微生物生態   微生物進化   日本酒造り   蔵付き微生物   

研究分野

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学
  • ライフサイエンス / 進化生物学
  • ライフサイエンス / 応用微生物学

経歴

  • 2022年04月 - 現在  東洋大学食環境科学部食環境科学科教授
  • 2013年04月 - 2022年03月  富山県立大学工学部生物工学科教授
  • 2005年11月 - 2013年03月  東京大学大学院農学生命科学研究科特任准教授
  • 2003年07月 - 2005年10月  特定国立研究開発法人理化学研究所ゲノム科学総合研究センター研究員
  • 1997年04月 - 2003年06月  東京大学分子細胞生物学研究所助手
  • 1996年04月 - 1997年03月  特定国立研究開発法人理化学研究所基礎科学特別研究員
  • 1994年04月 - 1996年03月  日本学術振興会特別研究員 (DC, PD)

学歴

  • 1990年04月 - 1995年03月   東京大学大学院   農学生命科学研究科   応用生命工学専攻
  • 1988年04月 - 1990年03月   東京大学   農学部   農芸化学科
  • 1986年04月 - 1988年03月   東京大学   教養学部   理科2類

研究活動情報

論文

書籍

  • 西田洋巳 翔雲社 2026年01月 ISBN: 4434371134 138
  • Microbiology and Health Benefits of Traditional Alcoholic Beverages
    Hiromi Nishida (担当:分担執筆範囲:Microbiology of sake)Elsevier 2024年10月 ISBN: 9780443133220
  • 西田, 洋巳 丸善プラネット,丸善出版 (発売) 2020年11月 ISBN: 9784863454699 viii, 177p
  • DNA traffic in the environment
    Nishida H; Oshima T (担当:編者(編著者)範囲:)Springer 2019年03月 ISBN: 9789811334115
  • Dickinson M, Hodgetts J (eds) Phytoplasma: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology, vol. 938
    Nishida H (担当:分担執筆範囲:Phylogenetic analyses of phytoplasmas based on whole-genome comparison)Humana Press 2013年
  • Nishida H, Kondo S, Nojiri H, Noma K, Oshima K (eds) Special Issue on Evolutionary Mechanisms of Microbial Genomes 2012, International Journal of Evolutionary Biology
    (担当:共編者(共編著者)範囲:)Hindawi Publishing Corporation 2012年
  • Nishida H, Kondo S, Nojiri H, Noma K, Oshima K (eds) Special Issue on Evolutionary Mechanisms of Microbial Genomes, International Journal of Evolutionary Biology
    (担当:共編者(共編著者)範囲:)SAGE-Hindawi Access to Research 2011年
  • Kurtzman CP, Fell JW, Boekhout T (eds) The Yeasts, a taxonomic study, 5th ed.
    Nishida H; Robert V; Sugiyama J (担当:分担執筆範囲:Mixia C.L. Kramer emend. H. Nishida, K. Ando, Y. Ando, Hirata & Sugiyama)Elsevier, Amsterdam 2011年
  • 杉山純多 (編) 菌類・細菌・ウイルスの多様性と系統
    西田洋巳; 杉山純多 (担当:分担執筆範囲:化学分類学的形質からみた多様性と系統; 遺伝情報からみた多様性と系統進化; 古生子嚢菌綱)裳華房, 東京 2005年
  • 鈴木昭憲, 荒井綜一 (編) 農芸化学の事典
    西田洋巳 (担当:分担執筆範囲:進化)朝倉書店, 東京 2003年
  • 日本の微生物分類－この20年
    西田洋巳 (担当:分担執筆範囲:古生子嚢菌類; サビ菌類・菌じん類)日本微生物分類研究会 2000年
  • 長谷川篤彦 (編) 獣医診療ハンドブック
    西田洋巳; 杉山純多 (担当:分担執筆範囲:菌類の系統分類)インターズー 1999年
  • Colwell RR, Simidu U, Ohwada K (eds) Microbial diversity in time and space
    Sugiyama J; Nagahama T; Nishida H (担当:分担執筆範囲:Fungal diversity and phylogeny with emphasis on 18S ribosomal DNA sequence divergence)Plenum Press, New York 1996年
  • 遺伝生態の諸問題
    杉山純多; 西田洋巳 (担当:分担執筆範囲:高等菌類の系統進化：形態と分子から探る)東北大学遺伝生態研究センター 1995年
  • Arai R, Kato M, Doi Y (eds) Biodiversity and Evolution
    Sugiyama J; Nishida H (担当:分担執筆範囲:The higher fungi: their evolutionary relationships and implications for fungal systematics)National Science Museum Foundation, Tokyo, Japan 1995年
  • Reynolds DR, Taylor JW (eds) The Fungal Holomorph: mitotic, meiotic and pleomorphic speciation in fungal systematics
    Sugiyama J; Nishida H; Suh S-O (担当:分担執筆範囲:The paradigm of fungal diagnoses and descriptions in the era of molecular systematics: Saitoella complicata as an example)CAB International, Wallingford, UK 1993年

講演・口頭発表等

  • 蔵付きバクテリア：見過ごされてきた日本酒造りにおける脇役  [招待講演]
    西田洋巳
    日本マイコトキシン学会第92回学術講演会 2025年01月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 日本酒造りと蔵付きバクテリア  [招待講演]
    西田洋巳
    東洋大学甫水会長野支部「日本酒セミナー」 2023年07月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 日本酒造りと蔵付きバクテリア  [招待講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2023年度大会BBB連携シンポジウム「清酒醸造の温故知新ーワイルド醸造学ー」 2023年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 見過ごされてきた蔵付きバクテリアの存在とその利活用  [招待講演]
    西田洋巳
    名古屋大学農学部セミナー 2022年09月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 蔵付きバクテリアと日本酒造り  [通常講演]
    西田洋巳
    第11回醗酵学フォーラム 2022年08月 口頭発表（一般）
  • お酒の中のDNA  [招待講演]
    西田洋巳
    弘前大学食料科学研究所第20回サイエンスカフェ 2022年08月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 微生物進化の原動力は何か？  [招待講演]
    西田洋巳
    キヤノン財団第１回講演会「微生物は縁の下の力持ち～サステナブルな未来をつくる微生物の不思議を考える～」 2022年08月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 西田洋巳
    富山県立大学秋季公開講座 2021年10月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • rodZ欠失のDeinococcus grandisのスフェロプラストはCa2+感受性が高まり巨大化しやすい  [通常講演]
    森田裕介; 奥村真衣; 鳴海一成; 西田洋巳
    日本農芸化学会 関西・中部支部合同神戸大会 2019年09月 口頭発表（一般）
  • 金属イオンがバクテリアスフェロプラストの巨大化に与える影響  [通常講演]
    西田洋巳; 西野弘起
    日本農芸化学会2019年度大会 2019年03月 口頭発表（一般）
  • バクテリアのスフェロプラスト巨大化  [招待講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2018年度大会シンポジウム「バクテリア細胞膜の機能および構造研究の新展開」 2018年03月 口頭発表（招待・特別）
  • アーキアのヒストンの分布はアーキアのゲノム塩基組成と関連している  [通常講演]
    西田洋巳; 大島拓
    第12回日本ゲノム微生物学会年会 2018年03月 口頭発表（一般）
  • 日本酒に含まれるDNAの網羅的シークエンスに基づく製造過程のモニタリング  [通常講演]
    西田洋巳
    富山県立大学リエゾンサポーター交流会 2017年11月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響  [通常講演]
    西田洋巳
    キヤノン財団第5回「理想の追求」シンポジウム 2017年07月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • お酒の中のDNA  [招待講演]
    西田洋巳
    弘前大学食料科学研究所サイエンスカフェ 2017年02月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 日本酒に含まれるバクテリアDNA  [招待講演]
    西田洋巳
    平成28年度第3回富山県立大学地域連携公開セミナー 2017年01月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 細菌スフェロプラスト巨大化  [通常講演]
    西田洋巳
    第3回東京大学・富山県立大学生物工学合同セミナー 2016年11月 口頭発表（一般）
  • 巨大化スフェロプラストの基礎および応用研究  [通常講演]
    西田洋巳
    平成28年度生物工学研究センター・ERATO研究成果合同発表会 2016年09月 口頭発表（一般）
  • DNA sequence bias between exonic and intronic regions causes nucleosome density difference in the filamentous ascomycetes Aspergillus  [招待講演]
    Hiromi Nishida
    1st International Caparica Conference in Splicing, Splicing 2016 2016年09月 口頭発表（招待・特別）
  • ヌクレオソーム形成とDNA塩基配列の偏り  [通常講演]
    西田洋巳
    第2回東京大学・富山県立大学生物工学セミナー 2015年11月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 細胞工学とゲノム工学の融合を目指して  [通常講演]
    西田洋巳
    富山県立大学生物工学研究センター成果発表会 2015年09月 その他
  • 古生子嚢菌類Saitoella complicataのRNAマップ解析およびヌクレオソームマップ解析  [通常講演]
    山内健太; 近藤伸二; 浜本牧子; 鈴木穣; 西田洋巳
    2015年度日本農芸化学会中部・関西支部合同大会 2015年09月 口頭発表（一般）
  • 古生子嚢菌類Saitoella complicataのゲノム解析  [通常講演]
    山内健太; 近藤伸二; 浜本牧子; 高橋裕里香; 小椋義俊; 林哲也; 鈴木穣; 西田洋巳
    新学術領域「ゲノム支援」2015年度拡大班会議 2015年08月 口頭発表（一般）
  • 海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響  [通常講演]
    西田洋巳; 野尻秀昭; 高橋裕里香; 畠俊郎
    キヤノン財団第3回「理想の追求」シンポジウム 2015年06月 口頭発表（一般）
  • 好気性海洋性紅色光合成細菌の細胞巨大化と脱巨大化  [通常講演]
    野尻茜; 荻田信二郎; 磯貝康弘; 西田洋巳
    第9回日本ゲノム微生物学会年会 2015年03月 口頭発表（一般）
  • 微生物におけるサイズと機能  [招待講演]
    西田洋巳
    日本学術会議公開シンポジウム「分野横断型農学の新展開に向けて―物理学・数理学の視点とその重要性―」 2015年03月 口頭発表（一般）
  • 好気性紅色光合成細菌の細胞巨大化と脱巨大化  [通常講演]
    野尻茜; 西田洋巳
    第5回醗酵学フォーラム 2014年11月 口頭発表（一般）
  • 海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響  [通常講演]
    西田洋巳
    キャノン財団第2回「理想の追求」シンポジウム 2014年07月 その他
  • アスペルギルスのヌクレオソーム形成に関する研究  [通常講演]
    西田洋巳
    野田産研研究助成研究成果報告会 2014年05月 口頭発表（招待・特別）
  • 菌類におけるエキソン、イントロン、塩基組成とヌクレオソーム形成  [招待講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2014年度大会 シンポジウム「微生物ゲノム設計の時代に塩基組成の機能と進化を再考する」 2014年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 菌類のヌクレオソームマップ解析から見えること  [通常講演]
    西田洋巳
    第6回北陸合同バイオシンポジウム 2013年11月 口頭発表（一般）
  • 菌類ヌクレオソームマップ解析  [通常講演]
    西田洋巳
    富山県立大学生物工学研究センター成果発表会 2013年10月 口頭発表（一般）
  • ゲノムにおける塩基置換の偏り  [招待講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2013年度大会 シンポジウム「バクテリア・コード：バクテリアの基本OSとは何か？」 2013年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • ゲノム塩基配列の偏りとバクテリア、アーキアの進化  [招待講演]
    西田洋巳
    第35回日本分子生物学会年会 ワークショップ「原核生物における種の定義：新時代のゲノム微生物学から種の規定を考える」 2012年12月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • ゲノム塩基置換と生物進化  [招待講演]
    西田洋巳
    東京農業大学 バイオサイエンスセミナー 2012年11月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • ゲノム配列からみた系統  [招待講演]
    西田洋巳
    日本進化学会第14回東京大会 ワークショップ「種(species)とは何なのか？原核生物での根源的な問い」 2012年08月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • ゲノム塩基配列の偏り、機能、進化  [招待講演]
    西田洋巳
    宮崎大学IR推進機構セミナー「ゲノムを基盤とした次世代微生物学研究の展開」 2012年07月 口頭発表（招待・特別）
  • 微生物ゲノム塩基組成の深遠さ  [通常講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2012年度大会 シンポジウム「ゲノムを知って作る：ゲノムはどこに向かうのか？」 2012年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 菌類重複遺伝子およびオルソログ遺伝子間におけるヌクレオソーム位置の比較  [通常講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2012年度大会 2012年03月 口頭発表（一般）
  • ゲノム進化における個を維持するシステム  [通常講演]
    西田洋巳
    第6回日本ゲノム微生物学会 シンポジウム「原核微生物における生物種とは何か？： 新時代のゲノム微生物学から種の規定を考える」 2012年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 担子菌類のヌクレオソームマップ解析  [通常講演]
    西田洋巳; 近藤伸二; 松本貴嗣; 鈴木穣; 吉川博文; Todd D. Taylor; 杉山純多
    第6回日本ゲノム微生物学会 2012年03月 口頭発表（一般）
  • Comparative studies of fungal nucleosome positioning  [招待講演]
    Nishida H
    15th Fungal Genetics and Biology Conference of the Microbiological Society of Korea 2012年01月 口頭発表（招待・特別）
  • 菌類におけるヒストン遺伝子内イントロンの進化  [通常講演]
    西田洋巳; 尹忠銖
    第11回糸状菌分子生物学コンファレンス 2011年11月 口頭発表（一般）
  • 微生物ゲノム比較とその進化  [通常講演]
    西田洋巳
    第2回醗酵学フォーラム 2011年11月 口頭発表（一般）
  • 菌類のヌクレオソームマッピング比較解析  [招待講演]
    西田洋巳
    第5回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会 2011年09月 口頭発表（招待・特別）
  • Comparison of nucleosome positions in promoters of orthologous genes between Aspergillus fumigatus and Sacchromyces cerevisiae  [通常講演]
    Nishida H
    4th International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology 2011年09月 口頭発表（一般）
  • 菌類の遺伝子プロモータ領域におけるクロマチン構造の比較に基づく系統分類学研究  [通常講演]
    西田洋巳
    公益財団法人発酵研究所第5回助成研究報告会 2011年06月 その他
  • 菌類のヌクレオソームマップ解析の意義  [招待講演]
    西田洋巳
    第32回糸状菌遺伝子研究会 2011年06月 口頭発表（招待・特別）
  • Nucleosomal DNA length and nucleosome positioning  [招待講演]
    Nishida H
    2nd World DNA and Genome Day 2011年04月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 微生物ゲノム比較に基づく系統樹の作成方法  [通常講演]
    西田洋巳
    微生物インフォマティクス・フォーラム研究交流会 2011年03月 口頭発表（一般）
  • Genome-wide maps of nucleosomes of TSA-treated and untreated cells of Aspergillus fumigatus  [通常講演]
    Nishida H; Motoyama T; Suzuki Y; Yamamoto S; Aburatani H; Osada H
    9th International Mycological Congress, Symposium "Fungal epigenetics" 2010年08月 口頭発表（一般）
  • Genome-wide map of fungal nucleosomes by the massively parallel DNA sequencing  [招待講演]
    Nishida H
    Seminar, Center for Informational Biology, Ochanomizu University 2010年05月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • 比較ゲノム学アプローチによる微生物の代謝ネットワークの多様性解析  [招待講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2010年度大会 シンポジウム「多面的アプローチによる微生物のエネルギー代謝研究の新化とモノづくりへの展開」 2010年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • トリコスタチンA処理のAspergillus fumigatusにおけるゲノムワイドヌクレオソームマップ解析  [通常講演]
    西田洋巳; 本山高幸; 鈴木穣; 山本尚吾; 油谷浩幸; 長田裕之
    第4回日本ゲノム微生物学会 2010年03月 口頭発表（一般）
  • Aspergillus fumigatusのヌクレオソームマップ解析  [招待講演]
    西田洋巳; 本山高幸; 山本尚吾; 油谷浩幸; 長田裕之
    第9回糸状菌分子生物学コンファレンス シンポジウム「ゲノム情報解析とその利用研究の最前線」 2009年11月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 枯草菌に水平伝播させたラン藻全ゲノムからの転写様式  [招待講演]
    西田洋巳; 板谷光泰
    日本農芸化学会2009年度大会 2009年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • カビの全ゲノムワイドヌクレオソームマップ解析  [通常講演]
    西田洋巳; 本山高幸; 山本尚吾; 油谷浩幸; 長田裕之
    第3回日本ゲノム微生物学会 2009年03月 口頭発表（一般）
  • ゲノム情報に基づく微生物機能解析  [招待講演]
    西田洋巳
    岡山大学次世代研究者・異分野研究連携コア育成支援事業「微生物研究における異分野融合」第4回講演会 2008年10月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • シアノバチルスのトランスクリプトーム解析  [招待講演]
    西田洋巳; 板谷光泰
    明治大学ワークショップ「大規模オミックス・データの利用と展望」 2008年09月 口頭発表（招待・特別）
  • 微生物ゲノムとインフォマティクス  [招待講演]
    西田洋巳
    第1回アグリバイオインフォマティクス研究会 2008年07月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • "シアノバチルス"におけるRNAマッピング  [通常講演]
    西田洋巳; 板谷光泰
    第2回日本ゲノム微生物学会年会 2008年03月 口頭発表（一般）
  • Exhaustive analysis of RNA expression in the cells containing of a genome combining the Synechocystis genome and the Bacillus genome  [招待講演]
    Nishida H; Itaya M
    The University of Tokyo International Symposium, Frontier of Microbial and Plant Biotechnology in Environmental and Life Sciences 2007年12月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 海洋に分布する微生物の多様性に関する研究  [通常講演]
    西田洋巳
    ソルト・サイエンス研究財団第19回平成18年度助成研究発表会 2007年07月 その他
  • 微生物のポストゲノムもおもしろい  [招待講演]
    西田洋巳
    第6回微生物研究会～微生物の潜在能力を探る～ 2007年07月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • タイリングアレイを用いた網羅的検出の有用性  [招待講演]
    西田洋巳
    第2回機能ゲノミクス研究会 2007年04月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 全ゲノム情報に基づくマイコプラズマ類の系統解析  [通常講演]
    西田洋巳; 大島研郎
    日本農芸化学会2007年度大会 2007年03月 口頭発表（一般）
  • 微生物ゲノム情報を基盤とした微生物学の展開  [招待講演]
    西田洋巳
    農学生命情報科学の大学院教育研究ユニット第3回シンポジウム 2007年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • ガンマブチロラクトン合成と受容の進化的関係  [招待講演]
    西田洋巳; 大西康夫; 別府輝彦; 堀之内末治
    日本進化学会2006年大会 ワークショップ「微生物の生き残り戦略と進化」 2006年08月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 菌類特異的遺伝情報の抽出  [通常講演]
    西田洋巳
    本農芸化学会2006年度大会 2006年03月 口頭発表（一般）
  • ヒトゲノムタイリングアレイを用いたヌクレオソーム密度に関する研究  [通常講演]
    西田洋巳; 鈴木貴紘; 近藤伸二; 林崎良英
    第28回日本分子生物学会年会 2005年12月 シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
  • 細胞のアイデンティティとその進化  [招待講演]
    西田洋巳; 田中寛
    日本農芸化学会2005年度大会 シンポジウム「細胞のアイデンティティとその進化」 2005年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 菌類特異的遺伝子を用いた研究：系統・進化・生態へのアプローチ  [招待講演]
    西田洋巳
    理研シンポジウム「ポストゲノム時代の糸状菌遺伝子研究」 2002年10月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • アミノアジピン酸還元酵素大サブユニット遺伝子（lys2）について  [通常講演]
    西田洋巳
    第22回微生物分類研究会 2002年09月 口頭発表（一般）
  • DeinococcusとThermusのリジン生合成の相違  [通常講演]
    西田洋巳; 鳴海一成
    日本農芸化学会2002年度大会 2002年03月 口頭発表（一般）
  • 菌類の進化を探る  [招待講演]
    西田洋巳
    日本進化学会第3回大会 シンポジウム「生物の系統進化の最前線 -バクテリアから高等動物まで-」 2001年10月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • アミノ酸生合成の進化と多機能タンパク質  [通常講演]
    西田洋巳
    日本農芸化学会2001年度大会 2001年03月 口頭発表（一般）
  • What is characteristic of fungal lysine synthesis through the aminoadipic acid pathway?  [招待講演]
    Nishida H
    Annual Meeting, 2000, of The Japan Society for Microbial Systematics - Microbial Systematics, Today and Tomorrow 2000年10月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 原核生物のアミノアジピン酸経路によるリシン合成の進化学的解析  [通常講演]
    西田洋巳; 西山真; 小橋信行; 小菅武英; 星野貴行; 山根久和; 小倉淳; 横田明
    日本農芸化学会2000年度大会 2000年04月 口頭発表（一般）
  • A prokaryotic gene cluster involved in synthesis of lysine through the aminoadipate pathway  [通常講演]
    Nishida H; Nishiyama M; Kobashi N; Kosuge T; Hoshino T; Yamane H; Yokota A
    International Symposium "Evolution 2000" - Biodiversity in Network of Bioinformation from the Standpoint of Devo-Evo View 2000年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
  • Pyrococcusのリシン生合成に関与すると考えられる遺伝子クラスター  [通常講演]
    西田洋巳; 西山真
    日本Archaebacteria研究会第12回講演会 1999年12月 口頭発表（一般）
  • Evolution in the Archiascomycetes  [招待講演]
    Nishida H; Sugiyama J
    XVI International Botanical Congress 1999年08月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • Molecular phylogeny and evolution of the urediniomycetes including Mixia and basidiomycetous yeasts  [招待講演]
    Nishida H; Sjamusuridzal W; Bauer R; Oberwinkler F; Kakishima M; Sugiyama J
    Sixth International Symposium of the Mycological Society of Japan - Joint Symposium of MSJ/BMS (British Mycological Society) 1998年11月 口頭発表（招待・特別）
  • 植物寄生菌類とその宿主の進化的関係  [通常講演]
    西田洋巳; Wellyzar Sjamsuridzal; 小川裕由; 柿嶌眞; 杉山純多
    日本菌学会関東支部年次大会 1998年04月 口頭発表（一般）
  • 寄生菌類と宿主植物の進化―サビ菌類の場合  [通常講演]
    西田洋巳; Wellyzar Sjamsuridzal; 小川裕由; 柿嶌眞; 杉山純多
    日本農芸化学会1998年度大会 1998年04月 口頭発表（一般）
  • 菌類系統解析の障壁を打ち砕いた分子系統  [招待講演]
    西田洋巳
    第14回糸状菌遺伝子研究会 1996年11月 口頭発表（招待・特別）
  • イントロンの多型と生物多様性：植物寄生菌類Protomyces属のグループIイントロンの進化学的解析  [通常講演]
    西田洋巳; 田尻義人; 杉山純多
    日本農芸化学会1996年度大会 1996年03月 口頭発表（一般）
  • 古生子嚢菌類の系統分類と進化  [招待講演]
    西田洋巳; 田尻義人; 杉山純多
    日本菌学会関東支部ミニシンポジウム「菌類系統分類学・進化学の最近の進歩」 1996年03月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 高等菌類の系統と分子進化  [招待講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    日本菌学会第39回大会シンポジウム「菌類の多様性：進化と生態」 1995年05月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 高等菌類Taphrina属菌種の多様性と宿主植物との進化的関係  [通常講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    本農芸化学会1994年度大会 1994年04月 口頭発表（一般）
  • A major lineage, which connects the ascomycetes with the basidiomycetes, inferred from the molecular approaches: Taphrina, Protomyces, Saitoella, and related taxa  [招待講演]
    Nishida H; Sugiyama J
    XV International Botanical Congress 1993年08月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • Horizontal transfer of the higher fungus Protomyces group I introns  [通常講演]
    Nishida H; Sugiyama J
    First Annual Society for Molecular Biology and Evolution Conference 1993年07月 口頭発表（一般）
  • タフリナ・プロトミケス両属の遺伝子レベルでの異同  [通常講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    日本菌学会第37回大会 1993年05月 口頭発表（一般）
  • 高等菌類の系統と分子進化  [招待講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    日本菌学会関東支部シンポジウム「菌類系統分類学研究の最近の展開」 1993年04月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • タフリナ・プロトミケスの系統進化的位置  [通常講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    日本農芸化学会1993年度大会 1993年04月 口頭発表（一般）
  • 18S rRNA gene及びそこに含まれるグループIイントロンの分子進化  [通常講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    日本分子生物学会第15回大会 1992年12月 口頭発表（一般）
  • 高等菌類の系統進化  [招待講演]
    西田洋巳
    国立遺伝学研究所研究会「分子系統学と生物分類学の接点」 1992年08月 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  • タフリナ科菌類：高等菌類における第三の系統群  [通常講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    日本農芸化学会1992年度大会 1992年04月 口頭発表（一般）
  • 18S リボゾーム RNA に基づく高等菌類の系統  [招待講演]
    西田洋巳; 杉山純多
    酵母細胞研究会主催シンポジウム 1991年12月 シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  • 担子菌酵母のリボゾームRNA置換頻度と分子系統  [通常講演]
    西田洋巳; 朱尤洪; 杉山純多
    日本農芸化学会1991年度大会 1991年04月 口頭発表（一般）
  • Thermus由来のリンゴ酸脱水素酵素（MDH）の耐熱化機構の解析  [通常講演]
    西山真; 西田洋巳; 堀之内末治; 別府輝彦
    日本農芸化学会1990年度大会 1990年03月 口頭発表（一般）

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 清酒酵母と蔵付きバクテリアの相互作用に関する研究
    東洋大学：井上円了記念研究助成
    研究期間 : 2024年06月 -2025年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 日本学術振興会：科学研究費補助金（基盤B）
    研究期間 : 2021年04月 -2024年03月 
    代表者 : 西田洋巳(代表); 小栁喬; 戸田弘
  • 県内酒蔵からの「蔵付き細菌」の単離とその日本酒醸造における有用性検証と活用法の検討
    富山県：フロンティア研究推進事業
    研究期間 : 2021年07月 -2022年03月 
    代表者 : 横井健二(代表); 荒川弦矢; 林伶南; 西田洋巳
  • Kocuria属細菌を利用した有用物質生産系の開発
    富山県立大学：重点領域研究遂行支援
    研究期間 : 2020年06月 -2021年03月 
    代表者 : 戸田弘(代表); 西田洋巳
  • 日本酒に混入・増殖する微生物の利活用による機能性日本酒造り
    富山県：大学連携加速化プロジェクト事業
    研究期間 : 2019年08月 -2020年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 日本酒に混入・増殖する微生物の利活用による機能性日本酒造り
    富山県：大学連携加速化プロジェクト事業
    研究期間 : 2018年07月 -2019年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 日本酒造りにおいて混入、増殖するバクテリアの日本酒への影響に関する研究
    富山県立大学：産学官連携研究費（生物工学研究センター特別研究）
    研究期間 : 2018年06月 -2019年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 日本酒に含まれるDNAの網羅的シークエンスに基づく製造過程のモニタリング
    富山県立大学：産学官連携研究費（生物工学研究センター特別研究）
    研究期間 : 2017年06月 -2018年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • バクテリア巨大化細胞への異種ゲノムDNAの導入方法の確立
    日本学術振興会：学術研究助成基金助成金（挑戦的萌芽）
    研究期間 : 2016年04月 -2018年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • FEMS 2017
    田村科学技術振興財団：研究者海外派遣助成金
    研究期間 : 2017年07月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 日本酒に含まれるDNAの網羅的シークエンスに基づく製造過程のモニタリング
    富山県立大学：産学官連携研究費（先行研究）
    研究期間 : 2016年06月 -2017年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 海洋を漂うプラスミドDNAが生物進化に与える影響
    一般財団法人キヤノン財団：研究助成プログラム「理想の追求」
    研究期間 : 2014年04月 -2017年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 富山の日本酒の現状と今後について考える
    富山県立大学：地域志向教育研究費
    研究期間 : 2015年06月 -2016年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 菌類のエキソン、イントロン構造の進化機構の解明
    日本学術振興会：学術研究助成基金助成金（基盤C）＋ゲノム支援
    研究期間 : 2013年04月 -2016年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 微生物を用いた効率的な有用物質生産を可能にするゲノム改変方法の確立
    富山県立大学：重点領域研究遂行支援
    研究期間 : 2014年06月 -2015年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • DNA塩基配列比較に基づく富山湾に存在する微生物の多様性解析
    富山県立大学：地域志向教育研究費
    研究期間 : 2014年06月 -2015年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 菌類ヌクレオソーム位置情報データ公開システムの構築
    富山県立大学：研究教育成果情報発信
    研究期間 : 2013年06月 -2014年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 微生物を用いた効率的な有用物質生産を可能にするゲノム改変方法の確立
    富山県立大学：重点領域研究遂行支援
    研究期間 : 2013年06月 -2014年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • アスペルギルスのヌクレオソーム形成に関する研究
    公益財団法人野田産業科学研究所：研究助成
    研究期間 : 2012年04月 -2013年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 菌類の遺伝子プロモータ領域におけるクロマチン構造の比較に基づく系統分類学研究
    公益財団法人発酵研究所：研究助成
    研究期間 : 2008年04月 -2011年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 水環境中の微生物群相解析へのマイクロアレイの使用に関する研究
    公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団：研究助成
    研究期間 : 2006年10月 -2007年09月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 海水に分布する微生物の多様性に関する研究
    公益財団法人ソルト・サイエンス研究財団：研究助成
    研究期間 : 2006年04月 -2007年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 菌類特異的遺伝子を指標にした菌類多様性に関する研究
    日本学術振興会：科学研究費補助金（若手B）
    研究期間 : 2003年04月 -2005年03月 
    代表者 : 西田洋巳
  • 菌類に分布するグループIイントロンの多様性に関する研究
    公益財団法人日産科学振興財団：研究助成
    研究期間 : 1996年04月 -1997年03月 
    代表者 : 西田洋巳

委員歴

  • 2025年 - 現在   Scientific Reports, Springer Nature   Editorial Board (microbiology)
  • 2019年 - 現在   Microbial Cell, Shared Science Publishers   Editorial Board (cell physiology and cell signaling)
  • 2017年 - 現在   Journal of General and Applied Microbiology, Applied Microbiology, Molecular and Cellular Biosciences Research Foundation   Advisory Board
  • 2024年   Special Issue on Applied and Fundamental Studies of Yeast in Fermented Foods and Beverages, Fermentation   Editor
  • 2022年   Research Topic on Microorganisms and Their Metabolism Affecting Quality, Safety and Functionality of Agricultural Products, Frontiers in Microbiology   Editor
  • 2017年 - 2021年   Open Bioinformatics Journal, Bentham Open   Editorial Board
  • 2008年 - 2021年   Advances and Applications in Bioinformatics and Chemistry, Taylor & Francis   Editorial Board
  • 2021年   Special Issue on Microbioinformatics, International Journal of Molecular Sciences   Editor
  • 2021年   Special Issue on Microbial Components and Function in Fermented Alcoholic Drink and Production Process, Microorganisms   Editor
  • 2020年   Special Issue on Bacterial Plasma Membrane Dynamics, International Journal of Molecular Sciences   Editor
  • 2019年   Special Issue on Bacterial Cell Surface, AIMS Microbiology   Editor
  • 2013年   Research Topic on Evolution and function of bacterial and archaeal genome sequences, Frontiers in Microbiology   Editor
  • 2012年   Special Issue on Evolutionary Mechanisms of Microbial Genomes 2012, International Journal of Evolutionary Biology   Editor
  • 2011年   Special Issue on Evolutionary Mechanisms of Microbial Genomes, International Journal of Evolutionary Biology   Editor

担当経験のある科目

  • 研究室演習
    東洋大学食環境科学部
  • 食品バイオテクノロジー
    東洋大学食環境科学部
  • 微生物代謝工学
    東洋大学食環境科学部
  • 食環境科学論文輪読
    東洋大学食環境科学部
  • 食品先端加工技術実習
    東洋大学食環境科学部
  • 醸造学特論
    東洋大学大学院食環境科学研究科
  • 基礎微生物学
    東洋大学食環境科学部
  • フードエンジニアリング
    東洋大学食環境科学部
  • 食品微生物利用学
    東洋大学食環境科学部
  • 食品衛生微生物学実験
    東洋大学食環境科学部
  • 応用酵素学
    東洋大学食環境科学部
  • 食環境科学英語２
    東洋大学食環境科学部
  • フードサイエンス実験Ⅰ
    東洋大学食環境科学部

メディア報道

  • 蔵付きバクテリアが日本酒の味に影響する--清酒酵母の遺伝子発現に対する蔵付きバクテリアの影響を解明
    報道 : 2024年06月20日
    発行元・放送局 : 沖縄タイムス，河北新報，北海道新聞，朝日新聞，読売新聞，AFPBB News，BIGLOBEニュースなど
    ウェブサイト　インターネットメディア
  • 酒の味変える「蔵つき」細菌 東洋大教授ら富山の酒蔵分析
    報道 : 2023年05月21日
    執筆者 : 本人以外
    発行元・放送局 : 東京新聞
    科学欄　新聞・雑誌
  • バクテリア巨大化 導入DNAで変化 県立大の西田研究室
    報道 : 2022年01月14日
    執筆者 : 本人以外
    発行元・放送局 : 富山新聞
    北陸総合面　新聞・雑誌
  • 蔵付きバクテリア確認 県立大 日本酒の味、風味に関与
    報道 : 2021年03月04日
    執筆者 : 本人以外
    番組・新聞雑誌 : 富山新聞
    富山総合面　新聞・雑誌
  • バクテリアを遺伝子操作しやすく人為的に巨大化 県立大工学部 西田教授ら確立
    報道 : 2020年06月02日
    執筆者 : 本人以外
    番組・新聞雑誌 : 北日本新聞
    社会・地域ニュース面　新聞・雑誌
  • バクテリア巨大化成功 県立大西田教授ら 1000倍まで培養
    報道 : 2019年05月17日
    執筆者 : 本人以外
    番組・新聞雑誌 : 北日本新聞
    社会面　新聞・雑誌
  • バクテリア進化のカギ握る？ 海に漂うDNA解析
    報道 : 2017年07月26日
    執筆者 : 本人以外
    番組・新聞雑誌 : 北日本新聞
    社会面　新聞・雑誌

その他のリンク

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