MF Researcher Database

Researchers Database

Advance

Hirokazu Shimosige

    Bio-Nano Electronics Research Center　Research Associate
Last Updated :2025/04/19

Researcher Information

Research funding number

  • 40622676

J-Global ID

Research Interests

  • 磁性細菌   バイオミネラリゼーション   磁性ナノ粒子   

Research Areas

  • Life sciences / Applied microbiology

Academic & Professional Experience

  • 2020/04 - Today  Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology超先鋭研究開発部門超先鋭研究開発プログラム外来研究員
  • 2018/10 - Today  Toyo Universityバイオ・ナノエレクトロニクス研究センター研究助手
  • 2011/04 - 2018/03  東洋大学バイオ・ナノエレクトロニクス研究センター研究助手

Association Memberships

  • JAPAN SOCIETY FOR BIOSICENCE, BIOTECHNOLOGY, AND AGROCHEMISTRY   日本微生物生態学会   

Published Papers

Conference Activities & Talks

  • Proteomic analysis of the sulfate-reducing magnetotactic bacterium, Fundidesulfovibrio magnetotacticus, grown in the presence of tryptophan
    H. SHIMOSHIGE; S. SHIMAMURA; T. MAEKAWA
    20th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Dec. 2023)  2023/12
  • Fundidesulfovibrio magnetotacticus sp. nov., a sulfate-reducing magnetotactic bacterium capable of forming bullet-shaped Fe3O4 nanoparticles  [Invited]
    H. SHIMOSHIGE
    19th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Dec. 2022)  2022/12
  • Fundidesulfovibrio magnetotacticus sp. nov., a novel sulfate-reducing magnetotactic bacterium isolated from a pond located in Saitama, Japan
    H. SHIMOSHIGE; H. KOBAYASHI; S. SHIMAMURA; T. MAEKAWA
    7th International Meeting on Magnetotactic Bacteria (Sep. 2022)  2022/09
  • Fundidesulfovibrio magnetotacticus sp. nov., a novel sulfate-reducing magnetotactic bacterium isolated from a pond in Saitama, Japan
    H. SHIMOSHIGE; H. KOBAYASHI; S. SHIMAMURA; T. MAEKAWA
    18th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Dec. 2021)  2021/12
  • A novel sulfate-reducing magnetotactic bacterium, designated strain FSS-1, belonging to the genus Fundidesulfovibrio  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Hideki Kobayashi; Shigeru Shimamura; Toru Maekawa
    16th International Symposium on Biomineralization  2021/08
  • Effect of amino acids on formation of bullet-shaped magnetite nanoparticles in Desulfovibrio sp. strain FSS-1
    H. SHIMOSHIGE; H. KOBAYASHI; S. SHIMAMURA; T. MIZUKI; A. INOUE; T. MAEKAWA
    17th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Dec. 2019)  2019/12
  • 淡水域底泥中からの新規硫酸還元磁性細菌の分離•培養  [Not invited]
    下重 裕一; 小林 英城; 島村 繁; 水木 徹; 井上 明; 前川 透
    日本農芸化学会2019年度 (平成31年度) 大会 東京 (2019年3月)  2019/03
  • Isolation of novel sulfate-reducing magnetotactic bacteria from freshwater sediments  [Not invited]
    H. SHIMOSHIGE; H. KOBAYASHI; S. SHIMAMURA; T. MIZUKI; A. INOUE; T. MAEKAWA
    16th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Dec. 2018)  2018/12
  • Isolation of a novel dissimilatory sulfate-reducing magnetotactic bacterium from freshwater sediments  [Not invited]
    H. SHIMOSHIGE; H. KOBAYASHI; S. SHIMAMURA; K. YANAGISAWA; T. MIZUKI; A. INOUE; T. MAEKAWA
    15th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Dec. 2017)  2017/12
  • 世界最深部に生息するヨコエビ外骨格の解析  [Not invited]
    小林 英城; 下重 裕一; 中島 義賢; 荒井 渉; 高見 英人
    第11回バイオミネラリーゼーションワークショップ (2016年11月)  2016/11
  • Magnetospirillum magneticum RSS-1株におけるマグネタイトと酸化サマリウムのコアシェルナノ粒子の形成  [Not invited]
    下重 裕一; 中島 義賢; 柳澤 圭一; 長岡 豊; 小林 英城; 水木 徹; 島村 繁; 井上 明; 前川 透
    日本農芸化学会2016年度 (平成28年度) 大会 (2016年3月)  2016/03
  • Formation of Fe3O4@Sm2O3 core-shell nanoparticles in magnetotactic bacteria isolated from a freshwater environment  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Yoshikata Nakajima; Keiichi Yanagisawa; Yutaka Nagaoka; Hideki Kobayashi; Toru Mizuki; Shigeru Shimamura; Akira Inoue; Toru Maekawa
    13th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Nov. 2015)  2015/11
  • 希土類元素含有磁性粒子を形成する磁性細菌の探索  [Not invited]
    下重 裕一; 水木 徹; 中島 義賢; 小林 英城; 島村 繁; 井上 明; 前川 透
    日本農芸化学会2015年度 (平成27年度) 大会 (2015年3月)  2015/03
  • Isolation of magnetotactic bacteria formed rare earth metals doping of magnetosomes from aquatic environments  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Hideki Kobayashi; Toru Mizuki; Yoshikata Nakajima; Akira Inoue; Toru Maekawa
    12th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Nov. 2014)  2014/11
  • Isolation of rare earth metals resistant magnetotactic bacteria from aquatic environments  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Hideki Kobayashi; Toru Mizuki; Akira Inoue; Toru Maekawa
    10th International Congress on Extremophiles (Sep. 2014)  2014/09
  • Isolation of novel magnetic nanoparticles doped with rare earth metals in magnetotactic bacteria from aquatic environments  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Toru Mizuki; Hideki Kobayashi; Akira Inoue; Toru Maekawa
    11th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Nov. 2013)  2013/11
  • Isolation of biologically synthesized novel magnetic nanoparticles in environmental magnetotactic bacteria  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Toru Mizuki; Hideki Kobayashi; Toru Maekawa
    10th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Nov. 2012)  2012/11
  • Identification of a novel magnesium chloride dependent haloarchaeon isolated from commercial salt  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Tomoaki Yamada; Hiroaki Minegishi; Akinobu Echigo; Yasuhiro Shimane; Masahiro Kamekura; Takashi Itoh; Ron Usami
    9th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Nov. 2011)  2011/11
  • 市販塩から分離された新規MgCl2依存性好塩菌の同定  [Not invited]
    下重 裕一; 山田 朋諒; 峯岸 宏明; 越後 輝敦; 嶋根 康弘; 亀倉 正博; 伊藤 隆; 宇佐美 論
    極限環境生物学会 第12回年会 (2011年11月)  2011/11
  • 高濃度MgCl2依存性の新規好塩性古細菌の探索  [Not invited]
    下重 裕一; 山田 朋諒; 峯岸 宏明; 越後 輝敦; 嶋根 康弘; 亀倉 正博; 伊藤 隆; 宇佐美 論
    日本農芸化学会関東支部2011年度大会 (2011年10月)  2011/10
  • Isolation of a novel halophilic archaeon with high magnesium requirement  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Tomoaki Yamada; Hiroaki Minegishi; Akinobu Echigo; Yasuhiro Shimane; Masahiro Kamekura; Takashi Itoh; Ron Usami
    International Union of Microbiological Societies (Sep. 2011)  2011/09
  • 大腸菌の高重力応答  [Not invited]
    下重 裕一; 小林 英城; 島村 繁; 宇佐美 論
    日本農芸化学会2011年度 (平成23年度) 大会 (2011年3月)  2011/03
  • Growth of Microorganisms under Hypergravities  [Not invited]
    Hirokazu Shimoshige; Shigeru Deguchi; Mikiko Tsudome; Ron Usami; Koki Horikoshi
    6th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, Toyo University (Nov. 2008)  2008/11
  • 100,000gでの大腸菌の増殖  [Not invited]
    下重 裕一; 出口 茂; 津留 美紀子; 宇佐美 論; 掘越 弘毅
    極限環境微生物学会第9回年会 (2008年11月）  2008/11
  • 微生物の増殖に対する重力の影響  [Not invited]
    下重 裕一; 出口 茂; 津留 美紀子; 宇佐美 論; 掘越 弘毅
    日本農芸化学会2008年度 (平成20年度) 大会 (2008年3月)  2008/03

MISC

Research Grants & Projects

  • Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    Date (from‐to) : 2021/04 -2024/03 
    Author : 下重 裕一
     
    磁性細菌は、酸化鉄または硫化鉄で構成されたチェーン状の磁性ナノ粒子（マグネトソーム）を細胞内に生合成する細菌である。本研究では、河口湖湖底表層堆積物中に生息する磁性ナノ粒子を大量合成可能な未培養ニトロスピラ門磁性細菌（以下、本菌と略す）に着目して、本菌の系統解析、RNA-seq解析、磁性ナノ粒子の構造解析およびその生息環境の詳細な分析を行い、培地での培養を試みることを目的とした。 令和3年度は、河口湖湖底表層堆積物を採取して本菌を培養後、系統解析、蛍光in situハイブリダイゼーション解析、透過型電子顕微鏡観察およびRNA-seq解析を実施予定だった。令和3年7月26日および令和3年12月10日に河口湖湖岸から柄杓を用いた湖底表層堆積物の採取と水中ドローンを使用した表層堆積物の採取を実施した。2Lプラスチック容器に湖底表層堆積物約700 mLと湖水約1300 mLを採取（計6本ずつ）し、実験室に運搬後、室温および暗所で培養を行った。運搬直後に本菌の存在を確認するために光学顕微鏡観察を行ったが、確認できなかった。これまでの本菌の培養実績から培養開始から約4カ月から1年以上経過すると本菌の存在および生育が確認されたため、培養約6カ月が経過した7月26日採取の堆積物中に存在する磁性細菌の詳細な菌叢を確認するために、アンプリコンシーケンス解析およびQIIME解析を実施した。その結果、主にプロテオバクテリア門ロドスピリラ科に属する湾曲状磁性細菌とプロテオバクテリア門マグネトコッカス目に属する球状磁性細菌の存在は確認されたが、本菌の存在は確認できなかった。

Teaching Experience

  • Advanced Practice of Bio-Nano Science II
    Toyo University
  • Advanced Practice of Bio-Nano Science I
    Toyo University
  • Extremophiles
    Toyo University
  • Microbiology
    Toyo University
  • Workshop on Advanced Equipment II
    Toyo University
  • Workshop on Advanced Equipment I
    Toyo University

Other link

researchmap